现代科学认为，木耳不但蛋白质丰富，而且富含多种维生素和矿物质，特别是铁元素含量极高，每100克干木耳含铁达185毫克，是肉类的100倍。因此，黑木耳是缺铁性贫血患者的极佳食品。黑木耳还有润肠解毒功能。黑木耳中的腺嘌呤核苷有显著的抑制血栓形成的作用，因此，还是中老年人的优良保健食品。
另外，黑木耳对胆结石、肾结石、膀胱结石、粪石等内源性异物也有比较显著的化解功能。黑木耳还含有多种矿物质，能对各种结石产生强烈的化学反应，剥脱、分化、侵蚀结石，使结石缩小，排出。
注意：黑木耳为补品，药力平缓，故只宜用于轻症、缓症或亚健康者的日常保健，若遇重症、急症当需配伍他药或作为治疗辅助品。此外，黑木耳较难消化，并有一定的滑肠作用，故脾虚消化不良或大便溏稀者忌用;对木耳及与其相类似真菌过敏者均忌服。
木耳食疗小偏方：
血管硬化、冠心病：黑木耳5克，清水浸泡一夜，蒸1小时，加适量冰糖，睡前服，连续食用;或加入菜肴、饺子或包子馅中，长期食用。
贫血：黑木耳30克，红枣30个，红糖少些，加入糯米中，熬成粥服食。
痔疮出血、便秘：黑木耳6克，柿饼30克，同煮烂，当成零食吃。
结石的辅助治疗：对于初发结石，保持每天吃1-2次黑木耳，疼痛、恶呕等症状可在2-4天内缓解，配合药物治疗，结石能在10天左右消失。对于较大较坚固的结石，其效果较差，应配合药物吃黑木耳。