肺炎匪类主要从解剖学和病因学两个方面进行分类。他们分别是：
一、解剖学分类
1.大叶性(肺泡性)肺炎
为肺实质炎症，通常并不累及支气管。病原体现在肺泡引起炎症，继之导致部分或整个肺段、肺叶发生炎症改变，致病菌多为肺炎链球菌。
2.小叶性(支气管)肺炎
指病原体经支气管入侵，引起细支气管、终末细支气管和肺泡的炎症。病原体有肺炎链球菌、葡萄球菌、病毒、肺炎支原体以及军团菌等。常继发于支气管炎、支气管扩张、上呼吸道病毒感染以及长期卧床的为重病人。
3.间质性肺炎
以肺间质炎症为主，病变累及支气管壁及其周围组织，有肺泡壁增生及间质水肿。可由细菌、支原体、衣原体、病毒或卡氏肺囊虫等引起。
二、病因学分类
1.细菌性肺炎
如肺炎链球菌(即肺炎球菌)、金黄色葡萄球菌、甲型溶血性链球菌、肺炎克雷白杆菌、流感嗜血杆菌、铜绿假单胞菌、埃希大肠杆菌、绿脓杆菌等。
2.非典型病原体所致的肺炎
如军团菌、支原体和衣原体等。
3.病毒性肺炎
如冠状病毒、腺病毒、流感病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒等。
4.真菌性肺炎
如白念珠菌、曲霉、放射菌等。
5.其它病原体所致的肺炎
如立克次体、弓形虫、原虫、寄生虫如肺包虫、肺吸虫、肺血吸虫)等。机体免疫力低下者(如艾滋病患者)容易伴发肺部卡氏肺包子虫、军团菌、鸟形分支杆菌、结核菌、弓形体等感染。
6.理化因素所致的肺炎
如放射性肺炎、胃酸吸入、药物等引起的化学性肺炎等。
7.支原体肺炎
由肺炎支气体引起