精神分裂症的病因目前还不明确，公认为多基因、多因素共同作用的结果。精神分裂症发病的相关因素包括遗传因素、大脑结构异常、脑递质异常、社会心理因素。
在家系调查中可以发现，有精神分裂症家族史的人群患病率高，特别是直系亲属，如父母、祖父母、兄弟姐妹患病时，患病率极高。
精神分裂症的患者CT、MRI、PET等检查，常会发现其脑部存在异常。部分患者有脑室扩大和脑皮质萎缩的表现，还可发现脑皮质、额部和小脑结构较小，脑容积的减少主要发生在脑灰质。
PET检查可发现精神分裂症患者发生幻听时，丘脑投射区有激活现象，而在进行心理测试时却不能像正常人一样出现前额叶、丘脑、小脑的激活现象。
老年精神分裂症的原因大全 精神分裂症的护理
除了脑结构的异常，精神分裂症患者还会出现中枢神经系统递质的变化。精神分裂症与社会阶层、经济状况等因素有关，患者病前性格多表现为内向、孤僻、敏感多疑。