功能性消化不良是一种常见的消化系统疾病，主要表现为上腹痛、腹胀、早饱(即少进食即有饱感，以致进食明显减少)、嗳气、食欲不振、恶心、呕吐等症状，病情常经年累月，呈持续性或反复发作。本病属功能性胃肠病，治疗上主要采取对症治疗，常用的药物有以下几四种：
一、抑制胃酸分泌药，一般适用于以上腹痛为主要症状的患者，可选择：(1)H2受体拮抗剂，常用的有西咪替丁，雷尼替丁，法莫替丁等;(2)质子泵抑制剂，此类药抑制胃酸程度和时间都优于H2受体拮抗剂，如奥美拉唑(洛赛克)每日20-40毫克，有明显疗效，也可选用兰索拉唑，潘托拉唑等。
二、促胃动力药，适用于以腹胀、早饱、嗳气为主要症状的患者，可用吗丁啉10毫克，一日3次，或西沙必利5-10毫克，一日3次，餐前15-30分钟服用，疗程2-8周。少数人服西沙必利后有肠鸣、腹泻等副作用，减少剂量或使用一段时间后，副作用可减轻或消失。
三、抗幽门螺杆菌治疗，适用于有幽门螺杆菌感染的患者，有效的抗生素有克拉霉素(每日0.5-1.0克)、阿莫西林(每日1.0-2.0克)、甲硝唑(每日800毫克)，可单独或联合应用，还可配合胶体铋剂，如枸橼酸铋钾、硫糖铝等。
四、抗抑郁药，不少患者伴有失眠、焦虑、抑郁、头痛、注意力不集中等精神症状，轻者可通过心理治疗，消除顾虑，精神症状明显者可试用三环类抗抑郁药如阿米替林，或氟西汀等，宜从小剂量开始。失眠者可适当服用镇静药。