煮熟的木瓜中，β胡萝卜素、B族维生素和维生素C几乎全部被破坏了，起不到保健作用。
另外，吃木瓜可以帮消化、清理肠胃，消灭人体内某些细菌和蛔虫，靠的是木瓜蛋白酶的作用。
但煮熟的木瓜经过高温加热会破坏蛋白酶，失去杀菌的效果。但要注意，北方木瓜不可以生吃，南方的番木瓜则可以。
3、木瓜搭配有禁忌
木瓜不能和海鲜一起吃，同吃会上火;木瓜不能和油炸食物一起吃，会引起肠胃不适。
并可能导致腹泻、呕吐;孕妇不宜吃木瓜，会引起子宫收缩、腹痛。
木瓜的最佳搭配食物
1、木瓜+玉米笋
木瓜能帮助消化及清理肠胃，可以抗癌、防衰老和降血压。玉米笋含有大量的脂肪、维生素等，它的食物纤维更有助于胃肠蠕动。
二者搭配对防治慢性肾炎和冠心病、糖尿病也有疗效。
2、木瓜+凤尾菇
木瓜除一般成分外，还含有木瓜蛋白酶和脂肪酶，其脂肪酶对脂肪有很强的分解能力，有一定减肥作用，并有健胃助消化的作用。
凤尾菇有补中益气、降血脂、降血压，以及提高免疫力的作用。两者搭配适合肥胖症患者食用。
3、木瓜+带鱼
两者搭配有营养、补虚、通乳的功效。
4、木瓜+牛奶
两者搭配含丰富的蛋白质、维生素A、维生素C及矿物质。木瓜有明目清热、清肠通便的功效。