慢性扁桃体炎时，隐窝内上皮坏死脱落，细菌及炎性渗出物聚集其中，隐窝可产生小溃疡及瘢痕形成而引流不畅，适于细菌生长繁殖，故感染不易消除。
屡发急性扁桃体炎，使机体抵抗力降低或治疗不彻底，则更易转为慢性。本病发生机理尚不清楚，但近年来基于免疫学的观点，认为自身变态反应为引起慢性扁桃体的重要机制。
扁桃体炎如此高发是何原因
1、扁桃体是呼吸道的门户，口鼻的细菌、病毒最先侵犯它。
2、扁桃体窝最易积存细菌和代谢物，是藏污纳垢的场所，只要湿度和温度适宜，很容易被感染。
3、扁桃体小窝小皮稀疏，其间常可见淋巴细胞和其它游走细胞，形成了“小窝上皮细网化”，而成为机体与病原体和毒素斗争的场所。
扁桃体炎是什么原因引起的
4、因扁桃体上有许多较深的小窝，如果患了扁桃体炎，病原体隐藏较深，极容易形成病灶，无论是口服用药，还是静脉给药，作用不直接，不能把病灶有效清除。