糖尿病的发病机制目前还未明了。一般认为肥胖是引起糖尿病的重要危险因素。已证实抗精神病药物特别是氯氮平和奥氮平能显著增加精神病人的体重，但肥胖不是药物所致糖尿病的唯一因素。有研究认为氯氮平可增加或影响胰岛素的分泌和引起胰岛素抵抗,机制可能与高体重指数、遗传因素、下丘脑多巴胺拮抗机制、5-羟色胺5-HT1a、5-HT2c、组胺H1有关。氯氮平可以拮抗下丘脑H1受体致食欲增加引起体重增加,干扰血脂代谢,使机体胰岛素抵抗性加大、糖耐量减低。氯氮平拮抗5-HT1a受体导致胰岛素分泌减少也可引起高血糖，从而增加了患糖尿病的概率。
警惕抗精神病药影响血糖
有学者认为抗精神病药物，特别是新型抗精神病药物与肥胖、血脂异常等代谢综合征核心因素有一定关系，同时指出氯氮平、奥氮平和利培酮均可致精神病患者体重增加，并与血清瘦素增加呈正相关，且氯氮平和奥氮平的影响大于利培酮。氯氮平、奥氮平和利培酮可通过增加体重引起与肥胖相关的胰岛素抵抗，且有扰乱血糖代谢的基础。