4、缺血
近期有人提出肛管后正中线缺血是肛裂好发于该处的原因，因为肛管远端是由直肠下动脉供应，该血管穿越坐骨直肠窝，分出小支经肛管括约肌至黏膜，但多数后联合处缺乏直肠下动脉分支（占85%）。从毛细血管形态学研究也提示后正中线处内括约肌内部的毛细血管较稀疏。有人应用激光多普勒血流仪测得肛管后联合处的血流较其他象限处为少。以上都说明缺血确是慢性肛裂发病的主要因素。
5、肛管狭窄
先天畸形、外伤或手术所致的肛管狭窄，在干结粪便通过时更易受损而发生肛裂。
6、内括约肌紧张
肛裂患者有不正常的内括约肌过度收缩现象。由于肛管部位损伤或炎症刺激，使肛门括约肌处于痉挛状态，致使肛管张力增强，易损伤成肛裂。反射性内括约肌痉挛目前认为是肛裂不易愈合的重要原因。
肛裂患者肛管内压力明显高于正常人达127.5±42.2kPa（956±316mmHg），而正常人仅为86.3±33.3kPa（647±250mmHg）。这种高压在经扩肛治疗后可恢复到接近正常。