2012年，美国科学促进会在一份声明中总结说：“通过生物科技的现代分子技术改良的农作物是安全的。”欧盟委员会同意这种说法，此前他们进行了25年的研究。美国医学会也是如此，不过该机构赞同进行更严格的上市前安全性检测。
科学家的论据大致是这样的：传统培育技术在长期内改变了动植物的基因。这是一个杂乱无章的过程。可能会出现随机的变异和预料之外的结果。然而，我们倾向于认为通过传统培育方式生产的食物大体“安全”。
因此，大部分科学顾问小组得出结论认为，利用基因工程技术改变植物DNA所造成的风险，并不明显高于传统培育方式所带来的风险。基因工程遵循的是同一原理，只不过更快、更精确。
转基因食品的危害有哪些
1、营养破坏
转基因食品中的主要营养成分、微量营养素及抗营养因子的变化，会降低食品的营养价值，使其营养结构失衡。科学家们认为外来基因会以一种人们目前还不甚了解的方式破坏食物中的营养成分。
2、或不安全
未进行较长时间的安全性试验：基因化食品改变了我们所食用食品的自然属性，它所使用的生物物质不是人类食品安全提供的部份，未进行长时间的安全试验，没有人知道这类食品是安全的。
3、嗜酸性肌痛
Mayeno,A.N.等（1994）报告，发生一种新的，不明原因的病症，主要表现为嗜酸性肌痛。临床表现有麻痹、神经问题、痛性肿胀、皮肤发痒、心脏出现问题，记忆缺乏、头痛、光敏、消瘦（Brenneman,D.E.等，1993；Love,L.A.等，1993）。后查明系日本一公司生的基因化工程细菌产生的色氨酸所致。食用者在3个月后发病，导致37人死亡，1500人体部份麻痹，5000多人发生偶尔性无力。据测定，含量为0.1%便可杀死人体。