有些中药本身常常具有一定的毒性及副作用，但又具有较好的治疗作用。为了使这些药物能够充分发挥其治疗疾病的作用，同时又不至于使病人发生毒性反应及副作用。因此，对这些具有毒副作用的药物需要做一定的加工处理以减少或消除其所含的毒性，中医称这种方法为炮制。常用的方法有：炒，就是将某些加工整理后的中药放在锅或其它容器内用火加热不断拌炒。根据药物的不同，将药炒到变黄、变脆或变焦等即可除去其毒性，如白术、积壳、鸡内金、斑蝥等中药都是经过炒制的方法除去其毒性及燥性等副作用的。
也有些药物为了去除其毒性及副作用，在炒制同时加入一定量的液体如黄酒、白酒、蜂蜜、盐水、姜汁、醋等以去除其毒性及燥性，这种方法称为炙，如炙甘草、炙黄芪、炙厚朴、炙香附等。经过炙制的药物，不仅去除了其毒副作用，而且还能增强药物的疗效。
除炒、炙等方法外，还有蒸、煮、烊(即用开水焯)、煨、烘、焙等方法加工药物，都可除去其存在的毒副作用。如蒸制熟地、桑螵蛸;煮制后的商陆、远志;烊制过的杏仁、桃仁;煨制过的木香、大黄;焙制的虻虫、瓦楞子等都是经过不同的炮制来除去药物的毒性、燥性等 副作用的。通过对药物的炮制，不仅能除去药物自身的毒性及副作用，而且还能除去药物上面的霉变、虫卵及杂质等。使药物更加纯洁干净。
除了通过炮制的方法来除去药物的毒性、副作用外，还可通过煎中药时除去药物的毒副作用。对于具有毒副作用的药物，如乌头、常山、甘遂等，在煎煮其它中药时先放入锅内使其煎煮时间长些也能去除药物的毒性及副作用。